La Fondation de l’école Fernand-Seguin est un organisme à but non lucratif, légalement constitué, dont la mission est de supporter la vocation scientifique de l’école.

Tout parent dont l’enfant fréquente l’école est d’office membre de la Fondation et peut donc assister aux réunions. Par contre, la Fondation s’est dotée d’un conseil d’administration dont seuls ses membres ont droit de vote.

Chaque année la Fondation organise plus d’une campagne de financement. En octobre 2017, la campagne Agrumes + est de retour.